Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Perm1Q149B8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Perm1Q149B8 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Perm1Q149B8 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Perm1Q149B8 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Perm1Q149B8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Perm1Q149B8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Perm1Q149B8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Perm1Q149B8 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Perm1Q149B8 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Perm1Q149B8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms