Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vps8Q0P5W1 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms