Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cxcr5Q04683 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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