Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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NfiaQ02780 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NfiaQ02780 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NfiaQ02780 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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NfiaQ02780 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NfiaQ02780 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NfiaQ02780 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NfiaQ02780 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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