Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxd1Q01822 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms