Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F8a1Q00558 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms