Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax8Q00288 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax8Q00288 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms