Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psmb4P99026 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms