Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gabpb2P81069 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gabpb2P81069 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms