Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otx1P80205 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms