Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp25P57080 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms