Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rad23bP54728 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rad23bP54728 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rad23bP54728 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rad23bP54728 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rad23bP54728 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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