Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms