Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
CntfP51642 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CntfP51642 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CntfP51642 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms