Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SftpbP50405 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SftpbP50405 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms