Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Hoxc13P50207 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Hoxc13P50207 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Hoxc13P50207 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Hoxc13P50207 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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