Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod1P49813 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tmod1P49813 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tmod1P49813 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tmod1P49813 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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