Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.4 ms