Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VdrP48281 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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VdrP48281 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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VdrP48281 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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VdrP48281 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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VdrP48281 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VdrP48281 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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VdrP48281 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VdrP48281 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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