Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pax9P47242 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax9P47242 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pax9P47242 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms