Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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PtgfrP43117 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
PtgfrP43117 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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