Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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