Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PpargP37238 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PpargP37238 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PpargP37238 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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PpargP37238 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PpargP37238 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PpargP37238 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PpargP37238 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PpargP37238 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PpargP37238 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PpargP37238 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PpargP37238 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PpargP37238 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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PpargP37238 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PpargP37238 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PpargP37238 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PpargP37238 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PpargP37238 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PpargP37238 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PpargP37238 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PpargP37238 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PpargP37238 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PpargP37238 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PpargP37238 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PpargP37238 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PpargP37238 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PpargP37238 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PpargP37238 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PpargP37238 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PpargP37238 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PpargP37238 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PpargP37238 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PpargP37238 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PpargP37238 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PpargP37238 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms