Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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