Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pabpc1P29341 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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