Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprmP28828 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtprmP28828 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprmP28828 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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