Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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RxrgP28705 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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RxrgP28705 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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