Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Defa5P28312 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Defa5P28312 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms