Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pde6aP27664 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6aP27664 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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