Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm45217-201ENSMUST00000206576 1026 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SnrpbP27048 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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