Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms