Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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