Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P18532 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P18532 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms