Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Nr4a1P12813 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms