Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms