Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PdgfrbP05622 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PdgfrbP05622 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PdgfrbP05622 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PdgfrbP05622 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PdgfrbP05622 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PdgfrbP05622 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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PdgfrbP05622 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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