Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P04224 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P04224 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P04224 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P04224 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P04224 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P04224 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P04224 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P04224 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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P04224 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P04224 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04224 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04224 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04224 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04224 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04224 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04224 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04224 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04224 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04224 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04224 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04224 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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