Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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