Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lnx1O70263 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms