Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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ChkaO54804 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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ChkaO54804 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
ChkaO54804 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms