Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms