Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KeraO35367 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KeraO35367 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KeraO35367 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KeraO35367 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KeraO35367 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KeraO35367 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KeraO35367 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms