Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dgcr6O35347 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms