Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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H2-Q1O19441 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-Q1O19441 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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