Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Casq1O09165 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Casq1O09165 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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