Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sec22bO08547 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms