Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Vmn1r34G3XA52 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Vmn1r34G3XA52 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Vmn1r34G3XA52 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vmn1r34G3XA52 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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