Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt78E9Q0F0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms