Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms