Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc175E9PVB3 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms